Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slit3Q9WVB4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slit3Q9WVB4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Slit3Q9WVB4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms