Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc2Q9R244 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc2Q9R244 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms