Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan3Q9QY33 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan3Q9QY33 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms