Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snai3Q9QY31 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms