Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms