Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pex3Q9QXY9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pex3Q9QXY9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pex3Q9QXY9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pex3Q9QXY9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex3Q9QXY9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex3Q9QXY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms