Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msh5Q9QUM7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msh5Q9QUM7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.6 ms