Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edf1Q9JMG1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edf1Q9JMG1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edf1Q9JMG1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms