Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot9Q9JKY0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot9Q9JKY0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms