Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pard6bQ9JK83 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pard6bQ9JK83 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms