Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc86Q9JJ89 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms