Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco4Q9JIS3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smco4Q9JIS3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms