Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra8Q9EQ48 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms