Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aph1cQ9DCZ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aph1cQ9DCZ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms