Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syvn1Q9DBY1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syvn1Q9DBY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syvn1Q9DBY1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms