Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms