Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc89Q9DA73 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms