Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmbim4Q9DA39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmbim4Q9DA39 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmbim4Q9DA39 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms