Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2dQ9D7M8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2dQ9D7M8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr2dQ9D7M8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2dQ9D7M8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms