Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gbe1Q9D6Y9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbe1Q9D6Y9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbe1Q9D6Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms