Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pfn4Q9D6I3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pfn4Q9D6I3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms