Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb4aQ9D6F9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb4aQ9D6F9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms