Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syap1Q9D5V6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syap1Q9D5V6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms