Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnbd2Q9D5U8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnbd2Q9D5U8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms