Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PudpQ9D5U5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PudpQ9D5U5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms