Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930470P17RikQ9D542 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930470P17RikQ9D542 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms