Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap53Q9D439 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap53Q9D439 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms