Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc47Q9D024 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms