Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp1Q9CYR0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms