Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CYI0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYI0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CYI0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CYI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CYI0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms