Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssr1Q9CY50 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr1Q9CY50 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms