Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xrcc3Q9CXE6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xrcc3Q9CXE6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms