Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc3Q9CW03 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smc3Q9CW03 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms