Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MINDY3Q9CV28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MINDY3Q9CV28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MINDY3Q9CV28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms