Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snw1Q9CSN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snw1Q9CSN1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms