Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NmbQ9CR53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms