Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PsenenQ9CQR7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PsenenQ9CQR7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms