Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl35Q9CQL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl35Q9CQL6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms