Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NenfQ9CQ45 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NenfQ9CQ45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NenfQ9CQ45 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms