Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt88Q9CPR6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt88Q9CPR6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms