Protein–RNA interactions for Protein: Q99N94

Mrpl9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl9Q99N94 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl9Q99N94 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl9Q99N94 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl9Q99N94 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms