Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col25a1Q99MQ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col25a1Q99MQ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col25a1Q99MQ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col25a1Q99MQ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col25a1Q99MQ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col25a1Q99MQ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col25a1Q99MQ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col25a1Q99MQ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms