Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nus1Q99LJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nus1Q99LJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nus1Q99LJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms