Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms