Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dok4Q99KE3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dok4Q99KE3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dok4Q99KE3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms