Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp3Q99JB6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp3Q99JB6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms