Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ddb2Q99J79 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ddb2Q99J79 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ddb2Q99J79 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ddb2Q99J79 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ddb2Q99J79 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ddb2Q99J79 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddb2Q99J79 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ddb2Q99J79 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ddb2Q99J79 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddb2Q99J79 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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