Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP4CQ96CF2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP4CQ96CF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP4CQ96CF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms