Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trps1Q925H1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trps1Q925H1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trps1Q925H1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms