Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb6Q922F4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb6Q922F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb6Q922F4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb6Q922F4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms